Desde un inicio el CIES ha recibido el apoyo básico de la Agencia Canadiense para el Desarrollo Internacional (ACDI) hoy Global Affairs Canada (GAC) y del Centro Internacional de Investigaciones para el Desarrollo (IDRC). Asimismo, cuenta o ha contado con la colaboración del Banco Central de Reserva del Perú, Banco Interamericano de Desarrollo, Banco Mundial, Fundación Ford, OXFAM, PNUD, Proyecto CRECER-USAID, Superintendencia de Banca y Seguros, CARE Internacional, Agencia Española de Cooperación Internacional (AECI), La Defensoría del Pueblo y el Ministerio de Economía y Finanzas.
- Agencia Canadiense para el Desarrollo Internacional (ACDI) hoy Global Affairs Canada (GAC)
- Centro de Investigación para el Desarrollo Internacional (IDRC)
- Agencia Española de Cooperación Internacional (AECID)
- CARE international
- Fundación Ford
- Delegación de la Unión Europea en el Perú
- Defensoría del Pueblo
- Policy Project – (USAID)
- Banco Mundial
- Banco Interamericano de Desarrollo (BID)
- Ministerio de Economía y Finanzas
- National Endowment for Democracy (NED)
- Embajada de Bélgica
- Banco Central de Reserva del Perú (BCRP)
- Oxfam GB
- Presidencia del Consejo de Ministros (PCM)
- Overseas Development Institute (ODI)
- Medicines Transparency Alliance (MeTA)