Para el CIES atender el proceso de descentralización es una tarea primordial. De este modo, el Consorcio viene impulsando diversas actividades dirigidas al desarrollo de capacidades y proporcionando la investigación aplicada para una mejor toma de decisiones públicas en el ámbito regional, para apoyar esta iniciativa se han conformado hasta la fecha cinco Consejos Consultivos Regionales CIES.